MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 8316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021738	AG	3	6	1418597	1418602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021738	CAT	2	6	1418608	1418613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_021738	AAAT	2	8	1421162	1421169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021738	AAAT	2	8	1421192	1421199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021738	A	6	6	1421215	1421220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021738	TCAAA	2	10	1421263	1421272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_021738	AAG	2	6	1421281	1421286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021738	A	6	6	1421304	1421309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021738	TC	3	6	1421533	1421538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_021738	AAT	2	6	1422298	1422303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021738	ATA	2	6	1422390	1422395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021738	CT	4	8	1422411	1422418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_021738	TC	4	8	1422450	1422457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_021738	GA	3	6	1422468	1422473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021738	A	7	7	1423058	1423064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021738	AAT	2	6	1423122	1423127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021738	AAAT	2	8	1423843	1423850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021738	CTT	2	6	1423853	1423858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_021738	A	7	7	1424808	1424814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021738	A	6	6	1424830	1424835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021738	AAC	2	6	1424874	1424879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_021738	CAA	2	6	1426511	1426516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021738	T	7	7	1426534	1426540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021738	TCC	2	6	1426558	1426563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_021738	G	6	6	1426586	1426591	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021738	AAAT	2	8	1426638	1426645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021738	ATT	2	6	1426660	1426665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021738	TTC	2	6	1426666	1426671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_021738	TAC	2	6	1426678	1426683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_021738	GA	3	6	1426731	1426736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021738	TGA	2	6	1426748	1426753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021738	T	6	6	1427849	1427854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021738	ATT	2	6	1427860	1427865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021738	CGCT	2	8	1430898	1430905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_021738	TC	3	6	1431140	1431145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_021738	TTG	2	6	1431167	1431172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021738	TA	3	6	1431202	1431207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021738	TAC	2	6	1431227	1431232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_021738	TCA	2	6	1431271	1431276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_021738	ATA	2	6	1431325	1431330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021738	CTT	2	6	1431355	1431360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_021738	T	6	6	1431722	1431727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021738	AG	3	6	1431762	1431767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021738	A	6	6	1431790	1431795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021738	A	6	6	1431836	1431841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021738	TA	3	6	1433415	1433420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021738	AGA	2	6	1433441	1433446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021738	AATC	2	8	1433512	1433519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_021738	TTTA	2	8	1434287	1434294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021738	ACGAAA	2	12	1434316	1434327	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5051	NC_021738	GACA	2	8	1434504	1434511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_021738	TCT	2	6	1434550	1434555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_021738	A	7	7	1434621	1434627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021738	T	6	6	1434693	1434698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021738	CAA	3	9	1434709	1434717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_021738	A	6	6	1434716	1434721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021738	GGC	2	6	1434739	1434744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_021738	TCTT	2	8	1434745	1434752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_021738	TTTTGC	2	12	1434784	1434795	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5060	NC_021738	TTAAA	2	10	1434840	1434849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021738	CGA	2	6	1434853	1434858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021738	CAC	2	6	1434882	1434887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_021738	GTC	2	6	1434957	1434962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_021738	TCT	2	6	1435065	1435070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_021738	TTC	3	9	1435080	1435088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_021738	ACA	2	6	1435173	1435178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_021738	AC	3	6	1435182	1435187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_021738	CGT	2	6	1435200	1435205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021738	CAA	2	6	1435212	1435217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021738	AC	3	6	1435223	1435228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_021738	AGC	2	6	1435377	1435382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021738	ACG	2	6	1435431	1435436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_021738	TGA	2	6	1435511	1435516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021738	CCG	2	6	1435539	1435544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_021738	ACC	2	6	1435625	1435630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_021738	TGTC	2	8	1435666	1435673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_021738	GCTT	2	8	1435684	1435691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_021738	CTC	2	6	1435744	1435749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_021738	GAG	2	6	1435763	1435768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021738	CCA	2	6	1435788	1435793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_021738	GGT	2	6	1435848	1435853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021738	ATTTCA	2	12	1436004	1436015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5083	NC_021738	CAT	2	6	1436043	1436048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_021738	GCC	2	6	1436118	1436123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_021738	GGCA	2	8	1436189	1436196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_021738	TAA	2	6	1436243	1436248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021738	CAGC	2	8	1436256	1436263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_021738	TC	3	6	1436371	1436376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_021738	ACC	2	6	1436401	1436406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_021738	TAA	2	6	1436431	1436436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021738	TCA	2	6	1436500	1436505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_021738	CTAAC	2	10	1436580	1436589	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5093	NC_021738	TTA	2	6	1436612	1436617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021738	CAG	2	6	1436790	1436795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_021738	CGACT	2	10	1436909	1436918	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5096	NC_021738	CTTT	2	8	1436933	1436940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_021738	TGG	2	6	1436944	1436949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021738	GTT	2	6	1437039	1437044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021738	CACC	2	8	1437068	1437075	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5100	NC_021738	GT	3	6	1437076	1437081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021738	TCGGT	2	10	1437284	1437293	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5102	NC_021738	GGA	2	6	1437602	1437607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021738	C	6	6	1437612	1437617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5104	NC_021738	TTG	2	6	1437652	1437657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021738	TCGC	2	8	1437770	1437777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_021738	CTA	2	6	1437780	1437785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_021738	CA	3	6	1437850	1437855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_021738	TAG	2	6	1437876	1437881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021738	TTC	2	6	1437883	1437888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_021738	CTT	2	6	1437971	1437976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_021738	A	7	7	1438068	1438074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021738	T	6	6	1438127	1438132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021738	TC	3	6	1438201	1438206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_021738	ATC	2	6	1438261	1438266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_021738	GAT	2	6	1438334	1438339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021738	TGG	2	6	1438340	1438345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021738	CCT	2	6	1438370	1438375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_021738	AGGC	2	8	1438383	1438390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_021738	TTC	2	6	1438431	1438436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_021738	TCGCT	2	10	1438445	1438454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5123	NC_021738	GTG	2	6	1438471	1438476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_021738	ACC	2	6	1438529	1438534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_021738	T	6	6	1438565	1438570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021738	TCT	2	6	1438572	1438577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_021738	TG	3	6	1438592	1438597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021738	AGG	2	6	1438627	1438632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021738	C	6	6	1438708	1438713	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5131	NC_021738	GT	3	6	1438768	1438773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021738	CGC	2	6	1438907	1438912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_021738	GT	3	6	1438937	1438942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021738	ATG	2	6	1438962	1438967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5136	NC_021738	CAA	2	6	1439040	1439045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_021738	GAC	2	6	1439101	1439106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5138	NC_021738	GCA	2	6	1439113	1439118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5141	NC_021738	TCC	2	6	1439450	1439455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5142	NC_021738	CCCT	2	8	1439495	1439502	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5143	NC_021738	GTT	2	6	1439514	1439519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5154	NC_021738	CTG	2	6	1440186	1440191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_021738	TAT	2	6	1440422	1440427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5166	NC_021738	T	6	6	1440483	1440488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_021738	A	6	6	1441313	1441318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_021738	TC	3	6	1441362	1441367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5174	NC_021738	T	6	6	1444334	1444339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5175	NC_021738	GCAA	2	8	1444340	1444347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5177	NC_021738	A	6	6	1444401	1444406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5178	NC_021738	TGG	2	6	1444421	1444426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5203	NC_021738	ATT	2	6	1460722	1460727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5207	NC_021738	AAT	2	6	1460832	1460837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_021738	GTAA	2	8	1469913	1469920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_021738	TATAT	2	10	1470768	1470777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5250	NC_021738	T	7	7	1473840	1473846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_021738	TAT	2	6	1473853	1473858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_021738	ATTT	2	8	1473867	1473874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_021738	CAAAAA	2	12	1473895	1473906	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5255	NC_021738	GTA	2	6	1473915	1473920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_021738	TA	3	6	1473977	1473982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_021738	GAG	2	6	1473985	1473990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_021738	TGG	2	6	1474105	1474110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_021738	ACT	2	6	1474130	1474135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5262	NC_021738	ACT	2	6	1474309	1474314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5264	NC_021738	CTTTC	2	10	1474356	1474365	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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